Первые признаки заболевания появляются у детей в возрасте 2—3 мес и даже раньше. Провоцирующим фактором является введение молочных смесей или перевод на смешанное и искусственное вскармливание. На коже волосистой части головы появляются серые и жирные чешуйки (гнейс), возникает ограниченное покраснение кожи щек с дальнейшим развитием мелких чешуек, иногда пузырьков (молочный струп), имеются опрелости в складках кожи, эритематозно-папулезные и эритематозно-везикулезные высыпания на коже туловища и конечностей. Экссудативные изменения вначале появляются на лице, в дальнейшем на волосистой части головы, шее, конечностях, туловище.

Характерным проявлением диатеза являются зудящие узелки (строфулюс) и везикулы, наполненные серозным содержимым. Пузырьки вскрываются, образуются эрозии, возникает мокнутие кожи, позднее — корочки. Поврежденные кожные покровы инфицируются. Развивается мокнущая экзема. Подобная симптоматика свидетельствует о пастозном типе атопического диатеза. При наличии на коже сухих, зудящих высыпаний речь идет об эретическом типе диатеза.

У детей возникают конъюнктивиты, блефариты, фарингиты, ларингиты, бронхиты, пневмонии. Легко развивается инфекция мочеполовых путей: уретриты, циститы, пиелонефриты, у девочек — вульвовагиниты, у мальчиков — баланиты. У больных диатезом наблюдаются «географический» язык, неустойчивость стула. Могут быть рахит, анемия.